Биохимия кала на инфекции
Обновлено: 17.04.2024
ГлавнаяHelixbook Посев кала на условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам
Микробиологическое исследование, позволяющее качественно и количественно охарактеризовать условно-патогенную флору кишечника, а также определить чувствительность к антибиотикам отдельных ее представителей.
Синонимы русские
Условно-патогенные микроорганизмы, условно-патогенные бактерии, условно-патогенные микробы, условно-патогенные возбудители, анализ на дисбактериоз, анализ на УПФ.
Синонимы английские
Opportunistic pathogens, opportunistic flora, opportunistic organisms, antibiotic susceptibility.
Метод исследования
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
- Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.
Общая информация об исследовании
Условно-патогенная флора – это микроорганизмы, которые присутствуют у человека в умеренных количествах. Однако при определенных условиях их количество увеличивается и превышает допустимую норму, что приводит к соответствующим заболеваниям. К наиболее распространенным представителям условно-патогенной флоры кишечника относятся золотистый стафилококк (S. aureus), клебсиеллы (Klebsiella), эшерихии (Escherichia), энтеробактер (Enterobacter), цитробактер (Citrobacter) и ацинетобактер (Acinetobacter), протей (Proteus), серрации (Serratia), псевдомонады (Pseudomonas), дрожжеподобные грибы (Candida и др.) и другие возбудители. Эти микроорганизмы могут вызывать инфекционное поражение желудочно-кишечного тракта с развитием гастроэнтерита, энтерита и энтероколита.
Посев кала на условно-патогенную флору с определением чувствительности к антибиотикам используется для диагностики кишечных инфекций, вызываемых условно-патогенными микроорганизмами, а также для определения чувствительности этих возбудителей к антибиотикам.
Для чего используется исследование?
- Для установления возбудителя кишечной инфекции.
- Для дифференциальной диагностики (наряду с другими исследованиями) заболеваний, протекающих со сходными симптомами (диарея, воспалительные заболевания кишечника, колоректальный рак, болезни, сопровождающиеся нарушением всасывания).
- Для того чтобы оценить эффективность проводимой антибактериальной терапии.
Когда назначается исследование?
Что означают результаты?
Если в посеве наблюдается умеренный рост условно-патогенных микроорганизмов (не превышающий норму), то утверждать, что они вызвали кишечную инфекцию, нельзя. Обильный рост условно-патогенных микроорганизмов (превышающий норму) свидетельствует о том, что они явились причиной развития инфекции.
Анализ содержания в кале короткоцепочечных жирных кислот — веществ, выделяемых кишечной. Проводится для оценки нарушений ее состава и метаболической активности при различных заболеваниях.
Приём и исследование биоматериала
Когда нужно сдавать анализ Биохимический анализ кала?
- Комплексная диагностика различных заболеваний кишечника (СРК, язвенный колит, дисбактериоз);
- Оценка успешности лечения болезней кишечника;
- Подозрение на нарушение состава кишечной микрофлоры;
- Состояние после оперативного вмешательства на кишечнике;
- Длительный прием антибиотиков.
Подробное описание исследования
Кишечник человека разделяется на несколько отделов. В тонком кишечнике происходит переваривание продуктов и всасывание большинства питательных веществ в кровь, в то время как в толстом кишечнике — расщепление сложных для переваривания компонентов пищи, таких как клетчатка. Это возможно благодаря деятельности микрофлоры — совокупности бактерий, обитающих в просвете и в пределах слизистой оболочки кишечника.
Микрофлора, или микробиота, кишечника включает в себя представителей бактерий, вирусов, грибов. Бактерии являются доминирующим среди них. Заселение микрофлоры происходит уже при рождении ребенка. Бактерии попадают в кишечник новорожденного с молоком матери и при контакте с ее кожей во время вскармливания. По мере того как младенец растет, а его рацион расширяется (время начала прикорма), кишечная микрофлора становится еще разнообразнее.
Микробиота взрослых людей обладает относительным постоянством состава. Однако ее существенные изменения происходят при различных заболеваниях пищеварительного тракта, таких как болезнь Крона, язвенный колит, синдром раздраженного кишечника. Также возможно нарушение состава микрофлоры на фоне лечения антибиотиками.
Нормальная микробиота кишечника выполняет ряд функций, крайне важных для поддержания здоровья человека:
- Участвует в регуляции иммунитета;
- Играет роль в расщеплении остатков пищи, формировании каловых масс;
- Производит витамины и другие необходимые вещества.
Одной из ключевых функций бактериальной флоры кишечника является продукция короткоцепочечных жирных кислот (КЖК). Среди них: уксусная, пропионовая, масляная и другие. Данные соединения играют ключевую роль во многих процессах:
- Поддерживают жизнедеятельность колоноцитов — клеток толстой кишки;
- Регулируют двигательную активность желудочно-кишечного тракта;
- Обладают противомикробными свойствами;
- Стимулируют рост новых клеток в кишечнике;
- Активируют иммунные реакции.
Спектр и количество производимых КЖК может отражать нарушения в составе и функциональной активности кишечной микрофлоры. Исследование используется в дополнение к посеву на условно-патогенную микрофлору кишечника, в рамках комплексной диагностики синдрома раздраженного кишечника (СРК), язвенного колита, болезни Крона, антибиотик-ассоциированного колита.
Особенности и преимущества методики
"Хромос ГХ-1000". Современный газовый хроматограф с цифровым управлением параметрами режима и обработки данных.
Анаэробный индекс (C2-C4)
Соотношение уровней различных КЖК отражает преобладание в составе микрофлоры кишечника тех или иных видов бактерий. Анаэробные микроорганизмы, продуцирующие КЖК:
уксусная - Bifidobacterium, Lactobacillus, Actinomyces, Ruminococcus;
пропионовая - Veillonella, Propionibacterium, Anaerovibrio;
масляная - Acidaminococcus, Bacteroides, Clostridium, Eubacterium, Fusobacterium, Lachnospira, Butyrivibrio, Gemmiger, Coprococcus;
изокислоты - Bacteroides, Megasphaera.
Общее содержание КЖК используется для оценки метаболической активности кишечной микрофлоры. Низкое общее содержание КЖК свидетельствует о понижении метаболической активности нормальной микрофлоры, возможном снижении моторики толстой кишки, а также о дефиците пищевых субстратов. Повышение общего уровня КЖК может отмечаться при избыточной колонизации толстой кишки отдельными представителями анаэробной микрофлоры, усилении ее метаболической активности, а также при ферментативной недостаточности и нарушениях всасывания.
Анаэробный индекс – отражает отношение строгих анаэробов к аэробам и факультативным анаэробам. Его повышение связано с угнетением популяции строгой анаэробной микрофлоры.
Согласно данным некоторых исследовательских работ, выявлены следующие закономерности изменения состава КЖК при различной патологии кишечника:
для синдрома раздраженного кишечника с преобладанием запоров характерно повышение содержания уксусной кислоты, увеличение отношения суммарного содержания изокислот к кислотам с неразветвленной цепью и смещение анаэробного индекса в сторону слабоотрицательных значений;
при СРК с диареей и неспецифическом язвенном колите отмечается повышение концентрации пропионовой и масляной кислот (однако повышение масляной кислоты при НЯК выражено больше), анаэробный индекс смещен в сторону резко отрицательных значений; кроме того, при СРК с запорами снижено отношение ИзоCn/Cn;
также выявлены закономерности изменения содержания КЖК в зависимости от локализации процесса при неспецифическом язвенном колите: при дистальном поражении уровни пропионовой и масляной кислот изменяются в одном направлении, при левостороннем и тотальном поражении их изменения разнонаправлены, при левостороннем возрастает уровень масляной кислоты, а при тотальном – пропионовой.
Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.
Синонимы русские
Синонимы английские
Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.
Метод исследования
Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
- Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.
Общая информация об исследовании
Острые кишечные инфекции (ОКИ) – группа заболеваний, обусловленных вирусами, бактериями или паразитами, для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Общими для данных инфекций являются факторы передачи: пищевые продукты, вода, инфицированные бытовые предметы и грязные руки. Первые симптомы возникают через несколько часов или дней после инфицирования, начало резкое, с появлением частого жидкого стула, рвоты, боли в животе, признаков интоксикации (лихорадки, озноба, тошноты). Заболевание может носить групповой характер и проявиться у нескольких человек, употреблявших инфицированную пищу или воду.
Согласно официальной статистике, в России до 65-67% заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90% заболеваний, на долю бактериальных – 10-20%; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30%.
Shigella species и Esherichia coli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии). Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев "бактериологически неподтвержденной дизентерии", особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.
Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и паратифа. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллез может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.
Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).
В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является "золотым стандартом" в клинической диагностике норовирусных инфекций.
Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНКсодержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки гастроэнтеритов у детей младшего возраста.
Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.
Читайте также: