Гепатит с мутация и резистентность
Обновлено: 27.03.2024
Метод определения полимеразная цепная реакция (ПЦР), секвенирование по Сэнгеру. Выявляют и идентифицируют кодонные замены в геномных регионах NS3, NS5A и NS5 вируса гепатита С. Регистрируют клинически значимые мутации резистентности, с порогом >15% популяции.
Выявление полиморфизмов NS3/NS5A/NS5B геномных регионов вируса гепатита С, ассоциированных с возможной резистентностью к терапии препаратами прямого противовирусного действия (для пациентов с генотипом вируса 1a, 1b или 3).
Вирусный гепатит C (ВГС) – инфекционное заболевание печени, вызываемое РНК-содержащим вирусом, склонное к длительному хроническому течению с риском развития цирроза и гепатоцеллюлярной карциномы. В терапии этого заболевания за последние годы достигнуты прорывные успехи – она стала эффективнее, проще, с меньшим числом побочных эффектов.
Терапией выбора при ВГС являются препараты прямого противовирусного действия (ПППД), воздействующие непосредственно на ферменты вируса, способные приводить к его полной элиминации. ПППД делятся на 3 основных класса – ингибиторы протеазы региона NS3/4A (участвует в посттрансляционной модификации вируса), ингибиторы белка NS5A (компонент репликационного комплекса вируса) и ингибиторы фермента NS5B (РНК-полимераза вируса). Действие таких лекарственных средств приводит к остановке деления вируса и препятствует заражению новых клеток. Однако, несмотря на высокую эффективность этих препаратов, примерно у 5% больных лечение с применением ПППД оказывается неэффективным. Установлена важная роль в этом ассоциированных с лекарственной резистентностью мутаций вируса.
Наиболее часты мутации в регионе NS5A при генотипах вируса 1а и 3. Степень резистентности к препарату может варьировать в зависимости от позиции полиморфизма. Клиническое значение выявленной мутации резистентности соотносится с определенным классом ПППД, иногда - конкретным препаратом, а также генотипом вируса, клиническими характеристиками пациента (по факту предыдущего лечения, наличию цирроза) и планируемым режимом комбинированной терапии.
Для клинической интерпретации полученных результатов следует ориентироваться на текущие рекомендации экспертных сообществ по лечению ВГС и информацию о значимых мутациях в рекомендациях по применению соответствующего препарата. Резистентность к одному препарату может компенсироваться активностью другого при использовании лечения комбинациями ПППД разных классов или увеличением длительности лечения. В условиях свободного доступа к разным режимам терапии, позволяющим оптимизировать лечение для лиц групп повышенного риска лекарственной резистентности, проводить исследования связанных мутаций вируса обычно не требуется. Однако, в условиях ограниченной доступности препаратов такие исследования могут быть полезны для выбора тактики терапии (EASL 2016, 2018).
Исследование проводится только пациентам с вирусным гепатитом С генотипов 1а, 1b или 3. Требуется заранее определить и указать выявленный генотип вируса гепатита С (протокол регистрации результатов исследования мутаций резистентности будет зависеть от указанного генотипа).
При уровне вирусной РНК в крови ниже 50 000 МЕ/мл проведение исследования невозможно - следует иметь представление о текущей вирусной нагрузке*.
Метод определения полимеразная цепная реакция (ПЦР), секвенирование по Сэнгеру. Выявляют и идентифицируют кодонные замены в геномных регионах NS3, NS5A и NS5 вируса гепатита С. Регистрируют клинически значимые мутации резистентности, с порогом >15% популяции.
Выявление полиморфизмов NS3/NS5A/NS5B геномных регионов вируса гепатита С, ассоциированных с возможной резистентностью к терапии препаратами прямого противовирусного действия (для пациентов с генотипом вируса 1a, 1b или 3).
Вирусный гепатит C (ВГС) – инфекционное заболевание печени, вызываемое РНК-содержащим вирусом, склонное к длительному хроническому течению с риском развития цирроза и гепатоцеллюлярной карциномы. В терапии этого заболевания за последние годы достигнуты прорывные успехи – она стала эффективнее, проще, с меньшим числом побочных эффектов.
Терапией выбора при ВГС являются препараты прямого противовирусного действия (ПППД), воздействующие непосредственно на ферменты вируса, способные приводить к его полной элиминации. ПППД делятся на 3 основных класса – ингибиторы протеазы региона NS3/4A (участвует в посттрансляционной модификации вируса), ингибиторы белка NS5A (компонент репликационного комплекса вируса) и ингибиторы фермента NS5B (РНК-полимераза вируса). Действие таких лекарственных средств приводит к остановке деления вируса и препятствует заражению новых клеток. Однако, несмотря на высокую эффективность этих препаратов, примерно у 5% больных лечение с применением ПППД оказывается неэффективным. Установлена важная роль в этом ассоциированных с лекарственной резистентностью мутаций вируса.
Наиболее часты мутации в регионе NS5A при генотипах вируса 1а и 3. Степень резистентности к препарату может варьировать в зависимости от позиции полиморфизма. Клиническое значение выявленной мутации резистентности соотносится с определенным классом ПППД, иногда - конкретным препаратом, а также генотипом вируса, клиническими характеристиками пациента (по факту предыдущего лечения, наличию цирроза) и планируемым режимом комбинированной терапии.
Для клинической интерпретации полученных результатов следует ориентироваться на текущие рекомендации экспертных сообществ по лечению ВГС и информацию о значимых мутациях в рекомендациях по применению соответствующего препарата. Резистентность к одному препарату может компенсироваться активностью другого при использовании лечения комбинациями ПППД разных классов или увеличением длительности лечения. В условиях свободного доступа к разным режимам терапии, позволяющим оптимизировать лечение для лиц групп повышенного риска лекарственной резистентности, проводить исследования связанных мутаций вируса обычно не требуется. Однако, в условиях ограниченной доступности препаратов такие исследования могут быть полезны для выбора тактики терапии (EASL 2016, 2018).
Исследование проводится только пациентам с вирусным гепатитом С генотипов 1а, 1b или 3. Требуется заранее определить и указать выявленный генотип вируса гепатита С (протокол регистрации результатов исследования мутаций резистентности будет зависеть от указанного генотипа).
При уровне вирусной РНК в крови ниже 50 000 МЕ/мл проведение исследования невозможно - следует иметь представление о текущей вирусной нагрузке*.
ГлавнаяHelixbook Генодиагностика резистентности к терапии гепатита С типов 1a, 1b, 3 (NS3, NS5A, NS5B)
Хронический гепатит С – это заболевание, вызываемое вирусом гепатита С и являющееся основной причиной развития цирроза печени и гепатоцеллюлярной карциномы. Заболевание излечимо с применением препаратов прямого противовирусного действия, однако мутации самого вируса гепатита С могут приводит к развитию устойчивости к терапии.
Синонимы русские
Лекарственная резистентность гепатита С.
Синонимы английские
Hepatitis C drug resistance.
Название гена
Метод исследования
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Как правильно подготовиться к исследованию?
- Не курить в течение 30 минут до исследования.
Общая информация об исследовании
Препараты прямого противовирусного действия (ПППД) произвели революцию в лечении гепатита C – применение современных безинтерфероновых схем лечения способно полностью элиминировать вирус из организма. Однако до 30 % всех случаев применения ПППД оканчиваются неудачей, несмотря на правильно подобранную терапию и соблюдаемый режим приема. Этот феномен связывают с наличием в геноме самого вируса мутаций резистентности к лекарственной терапии. Такие изменения приводят к устойчивости к терапии ПППД, но не влияют на жизнеспособность инфекционного агента, таким образом обуславливая персистенцию вируса в организме.
Различают три региона генома вируса, ассоциированные с лекарственной резистентностью: NS3 (кодирует белки пострансляционной обработки компонентов вируса), NS5A (отвечает за осуществление репликации вирусных частиц) и NS5B (несет последовательность фермента РНК-полимераза). В зависимости от локализации мутации приобретается устойчивость к соответствующей группе препаратов – ингибиторов NS3, NS5A и NS5B регионов. Стоит отметить, что степень влияния на эффективность конкретного препарата варьируется в зависимости от положения, в котором возникла аберрация (позиция аминокислотной замены). Наиболее часто встречаются мутации в регионе NS5A вирусов 1a и 3 типов. Также исследование внесено в современные международные клинические рекомендации по диагностике и лечению хронического вирусного гепатита C и рекомендовано к назначению при первичном подборе терапии ПППД и в случае неудавшейся предшествующей терапии.
Когда назначается исследование?
- Подбор схемы лечения хронического гепатита c препаратами прямого противовируного действия;
- Модификация терапии в случае развития первичной резистентности к терапии ПППД (отсутствие устойчивого вирусологического ответа в течение 12-24 недель после начала лечения).
- Изменение схемы лечения ПППД в случае развития вторичной лекарственной резистентности (возобновление репликации вируса после достижения устойчивого вирусологического ответа).
- Прогноз эффективности лечения хронического гепатита C препаратами прямого противовирусного действия.
Что означают результаты?
Название исследования и компоненты
Референсные значения
Резистентность к Асунапревиру (генотипы 1a, 1b гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Асунапревиром не выявлено
Резистентность к Боцепревиру (генотипы 1a, 1b гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Боцепревиром не выявлено
Резистентность к Воксилапревиру (генотипы 1a, 1b, 3 гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Воксилапревиром не выявлено
Резистентность к Велпатасвиру (генотипы 1a, 1b, 3 гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Велпатасвиром не выявлено
Резистентность к Глекапревиру (генотипы 1a, 1b, 3 гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Глекапревиром не выявлено
Резистентность к Гразопревиру (генотипы 1a, 1b гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Гразопревиром не выявлено
Резистентность к Даклатасвиру (генотипы 1a, 1b, 3 гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Даклатасвиром не выявлено
Резистентность к Дасабувиру (генотипы 1a, 1b гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Дасабувиром не выявлено
Резистентность к Ледипасвиру (генотипы 1a, 1b, 3 гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Ледипасвиром не выявлено
Резистентность к Омбитасвиру (генотипы 1a, 1b гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Омбитасвиром не выявлено
Резистентность к Паритапревиру (генотипы 1a, 1b гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Паритапревиром не выявлено
Резистентность к Пибрентасвиру (генотипы 1a, 1b, 3 гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Пибрентасвиром не выявлено
Резистентность к Симепревиру (генотипы 1a, 1b гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Симепревиром не выявлено
Резистентность к Софосбувиру (генотипы 1a, 1b, 3 гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Софосбувиром не выявлено
Резистентность к Телапревиру (генотипы 1a, 1b гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Телапревиром не выявлено
Резистентность к Элбасвиру (генотипы 1a, 1b, 3 гепатита С)
Мутаций резистентности к терапии Элбасвиром не выявлено
Наличие мутации резистентности предрасполагает к повышенному риску развития лекарственной резистентности к препарату прямого противовирусного действия. В зависимости от позиции аминокислотной замены и региона, в котором она располагается, вероятность развития устойчивости может разниться.
Отсутствие мутаций резистентности к препарату ПППД не гарантирует его эффективности, однако повышает вероятность успешности его применения.
Что может влиять на результат?
Несмотря на то что генетические исследования – точный метод лабораторной диагностики, время клинических проявлений заболевания (пенетрантность болезни) зависит от внешней среды, формы заболевания и индивидуальных генетических факторов.
Лекарственная устойчивость (резистентность) – природная или приобретенная способность возбудителя болезни сохранять жизнедеятельность при воздействии на него лекарственных средств. Как правило, лечение ХГВ проводится с применением аналогов нуклеозидов/нуклеотидов – ингибиторов РНК-зависимой ДНКполимеразы (обратной транскриптазы), которая кодируется Р-геном ВГВ. Противовирусный препарат встраивается в вирусный геном в процессе обратной транскрипции, и конкурентно ингибирует вирусную репликацию, т. о. эти лекарственные препараты эффективно снижают вирусную нагрузку у больных ХГВ. При возникновении некоторых точечных мутаций в Р-гене ВГВ аналоги нуклеозидов/нуклеотидов теряют способность встраиваться в растущую цепь ДНК вследствие конформационного изменения локуса связывания обратной транскриптазы. Мутации лекарственной устойчивости подразделяются на:
- основные (первичные) – мутации, снижающие чувствительность к противовирусному препарату;
- компенсаторные (вторичные) – мутации, которые компенсируют функциональные дефекты активности полимеразы, связанные с появлением первичной мутации.
Мутации устойчивости определяются по номеру позиции аминокислоты в домене обратной транскриптазы, причем аминокислота дикого типа указывается слева от номера аминокислоты, вариант мутации устойчивости – справа. Например, M204I – замена метионина, аминокислоты дикого типа, в 204 положении домена обратной транскриптазы на аминокислоту изолейцин, наличие которой в данной позиции ассоциировано с возникновением мутации лекарственной устойчивости.
Информация о наличии мутаций лекарственной устойчивости в геноме ВГВ необходима при выборе препаратов противовирусной терапии у пациентов, ранее получавших аналоги нуклезидов/нуклеотидов.
Показания к обследованию
Исследование предназначено для больных ХГВ в определенных случаях перед началом противовирусной терапии и во время приема противовирусных препаратов (Табл. 8).
Критерии назначения исследований для определения устойчивости ВГВ к противовирусным препаратам
Стадия ПВТ | Характеристика пациента | Назначение исследования |
---|---|---|
До начала ПВТ | Пациент лечения ранее не получал | Нет |
Ранее прерванное лечение | Да | |
Неудачное лечение | Да | |
Во время приема ПВП | Первичная резистентность (12 неделя ПВТ) | Да* |
Вирусологичесий рецидив | Да |
*Если пациент сохраняет приверженность к лечению.
Материал для исследования Плазма крови.
Методы лабораторных исследований
В клинической диагностике определение мутаций устойчивости вируса гепатита В к противовирусным препаратам включает ПЦР-амплификацию ревертазного домена Р-гена ВГВ и последующий анализ специфичных нуклеотидных последовательностей методами:
- прямого секвенирования амплифицированного фрагмента. Данный метод способен выявлять мутации устойчивости, если доля популяции вируса с мутацией составляет более 20%. Метод позволяет идентифицировать все мутации, включая дополнительные потенциальные компенсаторные и новые неизвестные;
Особенности интерпретации результатов
В результате проведенного исследования врач получает информацию по каждой аминокислотной позиции, ассоциированной с мутацией лекарственной устойчивости, и клиническую интерпретацию результатов исследования:
Читайте также: