Научная статья по изучению коронавирус антигенная структура

Обновлено: 18.04.2024

COVID-19 часто сопровождается нарушениями пищеварения, приводя к дефициту жизненно-важных веществ. Для восполнения недостатка нутриентов, укрепления иммунитета и более быстрого восстановления рекомендуется нутритивная поддержка сипинговыми смесями.

Обязательный этап восстановления после COVID-ассоциированной пневмонии – коррекция микрофлоры и восстановление нутриентной недостаточности. О том, как подойти к организации лечебного питания и о роли питательных смесей – рассказывает Сергеев В.Н.

COVID-19 часто сопровождается желудочно-кишечными симптомами и нутриентной недостаточностью. Сергеев В.Н. рассказывает о последних рекомендациях по организации лечебного питания и алгоритмах введения энтерального питания пациентам в критическом состоянии.

Большинство пациентов с COVID-19 нуждаются в специализированном питании для коррекции белково-энергетической недостаточности, поэтому в программу комплексной терапии рекомендуют включать нутритивную поддержку в виде энтерального и парентерального питания

До сих нет единого мнения о том, какие подходы к профилактике и лечению COVID-19 наиболее эффективны. П.А. Воробьев отвечает на главные вопросы диагностики и терапии заболевания, подчеркивая важность лечебного питания и нутриционной поддержки пациентов.

Е.В. Мелехина рассказывает о предикторах тяжелого течения COVID-19 у детей и влиянии нутритивной и витаминной недостаточности и факторов питания на иммунитет, делая акцент на эффективности пробиотиков и витаминов в профилактике и лечении инфекции.

В лекции В.М. Луфт обсуждает вопросы нутриционной поддержки пациентов с SARS-CoV-2 и последние рекомендации по субстратному обеспечению при дыхательной недостаточности, уделяя внимание особенностям выбора и эффективности энтеральных питательных смесей.

Течение COVID-19 часто сопровождается потерей массы тела, особенно в группах высокого риска. О профилактике и лечении недостаточного питания у лиц с инфекцией SARS-CoV-2 и роли микробиоты в предупреждении инфекции – в лекции И.Е. Хорошиловой.

Стресс напрямую снижает активность иммунной системы и увеличивает риск получения инфекции. Поддерживать психическое и физическое здоровье можно с помощью простых и понятных рекомендаций, но в некоторых случаях может потребоваться медикаментозная терапия

В обзоре представлены литературные данные о ближневосточном респираторном синдроме, опасном инфекционном заболевании человека, вызываемым новым коронавирусом MERS-CoV, характеризующимся развитием пневмонии, нередко — острого респираторного дистресс-синдро

Представлена современная таксономия коронавирусов, описана структура вириона коронавирусов, указаны этиологические агенты коронавирусного заболевания верхних дыхательных путей, описана клиническая картина и распространенность заболеваний, подходы к лечени

Актуальные проблемы

Специализации

Premium
Аллергология
Бронхопульмонология
Вакцинопрофилактика
Гастроэнтерология
Гепатология
Гинекология
Дерматовенерология
Иммунология
Инфекции
Кардиология
ЛОР-патология
Медтехника
Неотложная помощь
Нутрициология
Онкология
Педиатрия
Психоневрология
Ревматология
Сезонная аллергия
Терапия
Уронефрология
Фармакология
Эндокринология
ИТ в здравоохранении

Календарь событий:

Антигены коронавирусов. Оболочечная структура коронавирусов.

В N-концевой части гликопротеина S вируса ТГС выявлено четыре антигенных сайта (А, В, С, D) и идентифицировано 11 эпитопов, восемь из которых вируснейтрализующие. Главный эпитоп нейтрализации формируется, вероятно, аминокислотными остатками 380—387 с участием последовательностей из других частей белка S и представляет собой сложную конформационную структуру.

Нейтрализация вируса ТГС моноклональными антителами против gpS не зависела от комплемента, тогда как антитела против гликопротеина М тоже нейтрализовали вирус ТГС, но исключительно в присутствии комплемента. Нейтрализующие антитела к S и М-белкам выявили антигенную гетерогенность изолятов вируса ТГС.

Вирус ТГС обладает слабовыраженной гемагглютинирующей активностью, которая связана, вероятно, с М-гликопротеином вириона и зависит от хо-зяинной системы. Вирусный нуклеопротеин (N) не обладает способностью индуцировать синтез вируснейтрализующих антител. Однако, как и в случае с другими оболочечными вирусами животных, этот белок может служить мишенью для цитотоксических Т-клеток и определять перекрестную антигенную реактивность между различными коронавирусами.

В структуре респираторного коронавируса человека (РКВЧ) выявлено не три, а четыре мажорных полипептида: 200 кД (S), расщепляющийся трипсином на 110 и 90 кД; 130 кД (НЕ) гемагглютининэстераза, состоящая из двух субъединиц 65 кД, связанных дисульфидным мостиком; фосфорилированный (N) белок 55 кД; гликозилированный (М) белок 26 кД. Эти белки представлены в вирионе соответственно в количестве 88, 22, 726 и 726 молекул. По данным МФА, полевые изоляты (РКВЧ) не отличались от прототипного штамма 229Е, но отличались от него в перекрестной РН.

В составе оболочки коронавируса крупного рогатого скота также обнаружено три гликозилированных белка (S, М, НЕ). Инфекционность вируса in vitro нейтрализовали только МАТ к белкам S и НЕ, но не к М. Белок НЕ (47 кД, 424 аминокислотных остатка) ответственен за гемагглютинацию.

Представления об антигенной и геномной гомологии разных коронавирусов основаны на сравнительном изучении с использованием различных методов. Определена типовая (для вируса одного вида), групповая (для группы антигенно родственных вирусов: ТГС и РКВС) и межвидовая (коронавирусы собак, кошек, свиней) антигенная общность. В отличие от многих коронавирусов животных, вирус ТГС имеет один серотип.

Вирусы ТГС, инфекционного перитонита кошек и коронавирус собак обладают общими антигенами. В то же время вирус ТГС, гемагглютинирующий вирус свиней и вирус эпизоотической диареи свиней не имеют антигенного родства. Выделенный недавно респираторный коронавирус свиней (SRCV), получивший широкое распространение в ряде западноевропейских стран, оказался в антигенном отношении тесно родственным с вирусом ТГС. Главным биологическим отличием нового коронавируса является его исключительная пневмотропность при отсутствии энтеропатогенности. Оба вируса сходны между собой в антигенном отношении и имеют одинаковые нейтрализующие эпитопы в основных вирионных белках (N, S и М).

У кишечного коронавируса кроликов выявлено небольшое антигенное родство с вирусом инфекционного перитонита кошек, коронавирусом собак и вирусом ТГС. Прививка этими вирусами вызывала слабовыраженную защиту кроликов от коронавирусной инфекции.

Вирус эпизоотической диареи свиней по всем свойствам является типичным коронавирусом, хотя и не обладает антигенным родством с другими представителями данного семейства. Коронавирусы человека серологически связаны с коронавирусами крупного рогатого скота и мышей, гемагглютинирующим вирусом энцефаломиелита свиней. Три коронавируса грызунов (вирус гепатита мышей, коронавирус крыс, вирус сиалодакриоаденита крыс) имеют родство друг с другом и с коронавирусами человека. Коронавирус индеек, так же как вирус энцефаломиелита свиней, представлен одной антигенной разновидностью и имеет антигенное родство с другими коронавирусами. Тесная антигенная связь установлена между кишечными коронавирусами индеек и крупного рогатого скота. Двусторонняя антигенная связь установлена между коронавирусом индеек и коронавирусами кур и мышей.

Сравнивали антигенные свойства двух коронавирусов кошек: инфекционного перитонита (ИПК) и энтерита кошек (ЭК). Особенно большие различия в антигенной структуре выявлены с антителами к белку S в реакции нейтрализации вируса.

Выявлена интересная зависимость между вирулентностью коронавирусов кошек и клеточным тропизмом. Вирулентные штаммы в основном поражают моноциты, авирулентные — реплицируются в эпителии кишечника. Возможно, эти два коронавируса кошек являются биотипами одного и того же вируса. Моноклональные антитела к вирусу инфекционного перитонита кошек (ИПК) типа II нейтрализовали коронавирусы энтерита кошек, собак и вирус ТГС, но не реагировали с вирусом инфекционного перитонита кошек типа I. Иными словами, межвидовое антигенное родство оказалось более тесным, нежели типоспецифическая дивергенция. На примере вируса гепатита мышей показано, что основным местом персистенции вируса является передняя часть верхнего отдела спинного мозга. Реактивация персистирующей вирусной РНК приводила к возникновению клинически выраженного заболевания. Подобный механизм может иметь место при персистенции других коронавирусов в животном организме.

Информация на сайте подлежит консультации лечащим врачом и не заменяет очной консультации с ним.
См. подробнее в пользовательском соглашении.

Антигены коронавирусов. Патогенез, клиника поражений коронавирусов. Диагностика, лечение коронавирусов.

По составу антигены коронавирусов разделяют на четыре антигенные группы. Антигены коронавирусов человека значительно отличаются от антигены коронавирусов, патогенных для животных.

Антигенная гетерогенность коронавирусов обусловливает высокую частоту реинфекций другими сероварами.

Патогенез и клинические проявления поражений коронавирусов

В основе заболевания лежит цитопатическое действие коронавирусов в месте проникновения. Инкубационный период поражений коронавирусов длится 2-5 сут.

Респираторные инфекции коронавирусов протекают по типу катара верхних отделов дыхательных путей. Типичны катаральный ринит и ринофарингит с обильным серозным (реже серозно-гнойным) отделяемым. Через 5-7 сут наступает спонтанное выздоровление, сопровождающееся развитием стойкой невосприимчивости к серовару, вызвавшему инфекцию.

Принципы микробиологической диагностики коронавирусов

Проводят вирусоскопические и серологические методы диагностики коронавирусов. Материалом для исследований служат слизь из зева, носовое отделяемое и кровь. Для экспресс-диагностики используют РИФ, выявляющую Аг вирусов в носовом отделяемом и клетках слизистой оболочки. Вирусспецифи-ческие AT в парных сыворотках определяют в РТГА, РН (выявляют как свежие, так и давно перенесённые инфекции) и РСК (позволяет выявить только свежие случаи).

Лечение и профилактика поражений коронавирусов

Большое количество антигенных вариантов коронавирусов делает бессмысленным изготовление вакцин и проведение иммунопрофилактики. Общие методы профилактики аналогичны таковым при гриппе и прочих ОРВИ. Средства этиотропной терапии отсутствуют. При тяжёлых формах может быть использован специфический Ig, изготовленный из сыворотки взрослых доноров. В РФ применяют препарат, содержащий высокие титры AT к вирусу ОС43, представляющему наибольшую эпидемическую опасность.

Геном коронавирусов. Структура генома коронавирусов.

Геном коронавирусов представлен линейной молекулой оц(+)РНК размером 27-32 тн. Геномная РНК имеет кэп-структуру на 5'-конце, поли-А структуру на 3'-конце и обладает инфекционностью.

Независимо от различий в структуре вирионов, размере генома корона-, то-ро- и артеривирусы сходны по организации генома и стратегии репликации. Все они используют гнездовую стратегию транскрипции, т.е. экспрессия их генов происходит через стадию образования нескольких З'-котерминальных субгеномных мРНК.

Коронавирусы обладают сложной стратегией экспрессии генома. Вирионная РНК служит в качестве мРНК для синтеза РНК-зависимой РНК полимеразы. Две крупных открытых рамки считывания (обший размер около 20 тн), кодирующие полимеразу, транслируются последовательно посредством сдвига рибосомальной рамки в виде одного полипротеина, который затем расщепляется. Из этих протеинов затем формируется активная полимераза, которая транскрибирует геномную (+)РНК с образованием полноразмерной комплементарной (-)РНК.

На этой копии с помощью обратной транскрипции образуется не только полноразмерная геномная (+)РНК, но также гнезда 3'-концевых субгеномных мРНК. Эти гнезда содержат от 5 до 7 (у разных вирусов) перекрывающихся мРНК, которые определяют длину от З'-конца и долю участия общей 5'-лидерной последовательности. Они генерируются лидер-праймерным механизмом прерывистой транскрипцией: полимераза в первую очередь транскрибирует некодирующую лидерную последовательность с З'-конца комплементарной (-)РНК. Затем, кэппирированная лидерная РНК отделяется от матрицы и воссоединяется с комплементарной последовательностью на старте любого гена, чтобы продолжать правильно копировать матрицу вплоть до 5'-конца. Транслируется только уникальная последовательность.

Такая последовательность дает урожай различных вирусных белков в регулируемых количествах. Межгенные последовательности служат промоторами и ослабляют транскрипцию.

Торовирусы транскрибируются и реплицируются подобно коронавирусам, за исключением отсутствия общих 5'-лидерных последовательностей на мРНК. Загадочная находка состоит в том, что субгеномные (—)РНК, комплементарные гнездовым мРНК, также присутствуют в клетках, инфицированных коронавирусом. Факт, что субгеномные РНК содержат 5'- и З'-концевые последовательности, идентичные геномным РНК, означает, что они могут функционировать как репликоны.

Синтез, процессинг, олигомеризация и транспорт некоторых гликопротеинов оболочки коронавирусов демонстрируют некоторые необычные картины. Например, оболочечный белок М, который у некоторых коронавирусов содержит О-связанные, а не N-связанные гликаны, направляется исключительно к цистернам эндоплазматического ретикулюма.

В результате этого вирионы почкуются только здесь, а не от плазматической мембраны. Вирионы затем транспортируются в везикулах к плазматической мембране и освобождаются экзоцитозом. После освобождения многие зрелые оболочечные вирионы остаются прикрепленными к клетке снаружи. Репликативный цикл целиком совершается в цитоплазме и может происходить в клетках с удаленным ядром. При размножении с высокой множественностью заражения появляются ДИЧ с укороченным РНК геномом, которые имеют селективные преимущества по сравнению со стандартными вирионами.

Генетическая рекомбинация происходит с высокой частотой между геномами различных, но родственных между собой коронавирусов. Это может быть важным механизмом появления генетически измененных вирусов в природе. Кроме относительно частых спонтанных мутаций (примерно 3 мутации в процессе репликации на каждые 30 тн) в генотипическом разнообразии коронавирусов важную роль играет рекомбинация. Она приводила к изменению антигенности вируса инфекционного бронхита птиц (ИБП). Рекомбинацию между вакцинными и вирулентными штаммами вируса ИБП наблюдали у цыплят в полевых условиях. Рекомбинация между геномами коронавирусов собак и кошек, вероятно, привела к появлению коронавируса, передающегося кошкам горизонтально. Имеются доказательства, что вирус инфекционного перитонита кошек является мутантом эпизоотического коронавируса энтерита кошек, что способствовало системному распространению и персистенции вируса.

Исследования, проведенные главным образом на модели вируса гепатита мышей, показали, что большой поверхностный пепломерный гликопротеин S представляет собой первичный продукт трансляции. Он имеет N-концевую сигнальную последовательность и С-концевой гидрофобный мембранный домен. У некоторых, хотя и не у всех, коронавирусов гликопротеин S расщепляется на две субъединицы: SI (gpl20) и S2 (gplOO). С-концевая субъединица (S2) несет фузогенный участок, активность которого усиливается после протеолитического расщепления. В отличие от орто- и парамиксовирусов, фузогенный сайт, вероятно, локализован не в месте расщепления, а там, где лежит длинная последовательность гидрофобных аминокислот. Второй особенностью белка S является то, что в цитоплазматическом домене содержатся кластеры цистеина (трицистеин и два дицистеина). Нечто подобное обнаружено в цитоплазматическом домене альфавирусов. Большая часть белка S находится снаружи вириона и обеспечивает его прикрепление к клеткам. Он экспонируется на поверхности инфицированных клеток и определяет их чувствительность к Th лимфоцитам. Интегральный мембранный гликопротеин М погружен довольно глубоко в оболочку вириона, на поверхности которого выступает лишь небольшой участок этого белка. N-конец с гидрофобным участком расположен снаружи вириона, а гидрофильный С-конец — с внутренней стороны липидной мембраны. Наиболее важная особенность гликопротеина М — та, что он является основным индуктором интерферона. В отличие от других вирусных гликопротеинов, он не экспонируется на плазматической мембране инфицированных клеток. М-гликопротеин коронавирусов не следует отождествлять с матриксным белком других вирусов. По своей структуре этот белок существенно отличается от матриксных белков пара- и ортомиксовирусов. Коронавирусы с хорошо выраженной гемагглютинирующей активностью содержат НЕ-белок, хотя его наличие в структуре вириона не обязательно свидетельствует о способности вируса вызывать гемагглютинацию эритроцитов. Антигенные свойства коронавирусов изучены недостаточно детально. Имеющиеся данные дают возможность считать, что пепломерный гликопротеин S является наиболее важным в антигенном и иммуногенном отношении структурным компонентом коронавирусов, поскольку в основном этот белок индуцирует синтез вируснейтрализующих антител. В образовании напряженного иммунитета к вирусу ИБП, кроме основного белка S, принимает участие также белок М, который в меньшей степени участвует в индукции синтеза ВН-антител, но ответственен за синтез антител, тормозяших ГА.

На белке S вируса ИБП выявлено восемь эпитопных групп. Шесть из них обладали выраженной ВН-активностью.
В гликопротеине S вируса гепатита мышей (ВГМ) выявлено четыре антигенных сайта, участвующих в слиянии клеток, вирулентности и нейтрализации вируса. Антитела к гликопротеину М ВГМ обладали протективным действием, хотя эта способность не коррелировала с ВН-активностью in vitro. Учитывая неполную клиническую защиту, можно полагать, что антитела к белку М способны если не предотвратить, то хотя бы смягчить течение заболевания.

Консервативный нейтрализующий эпитоп ВГМ, индуцирующий синтез протективных ВН-антител, представлен аминокислотами в позиции 848—856 гликопротеина S. Полагают, что участок этого белка, ответственный за слияние, также вовлечен в обеспечение протективного иммунитета. Главные нейтрализующие эпитопы вируса локализованы в N-концевом участке субъединицы S1 пепломерного белка S.

На белке S вируса трансмиссивного гастроэнтерита свиней (ТГС) имеется по крайней мере два главных антигенных участка, ответственных за синтез ВН-антител.

COVID-19 — Пандемия коронавируса представляет собой серьезную глобальную проблему. За считанные недели вирус распространился из Китая в большинство стран мира, превысив психологически значимые отметки в 100 000 зараженных и 1000 погибших.

Из-за непереставаемого потока новостей и истерии СМИ можно упустить из виду ключевые события, происходящие на фронте борьбы с вирусной инфекцией.

Спецпроект посвящен актуальной информационной повестке по пандемии COVID-19 на основе доказательного подхода и оптимистичного взгляда на эту проблему.

Что сейчас известно о механизмах развития постковидного синдрома? Можно ли уменьшить его выраженность? Как снизить риск сердечно-сосудистых осложнений COVID-19 и при чем здесь эндотелий? Ответы на эти и другие вопросы – в нашем новом видеоролике

В статье рассмотрены молекулярные механизмы патогенеза и психогенные факторы, определяющие риск развития неврологических осложнений коронавирусной инфекции в общей популяции и у пациентов с когнитивными нарушениями

Каждый четвертый пациент на фоне перенесенного COVID-19 испытывает симптомы постковидного синдрома – одышку, усталость, обострение хронических заболеваний. В видео мы собрали актуальную информацию по диагностике и лечению постковидного синдрома

Увеличение числа пациентов, перенесших COVID-19, сопровождается стремительным ростом частоты психоневрологических нарушений. О действии SARS-CoV-2 на нервную систему и современных методах коррекции тревожных расстройств – в обзоре лекции Г.Р. Табеевой

Многофакторное действие сулодексида на различные биологические мишени делает его перспективным средством для снижения риска госпитализации и тяжелого течения COVID-19. Доказательства клинической эффективности препарата рассмотрим в ролике

Нутритивная поддержка прочно вошла в комплекс терапевтических мероприятий, широко применяемых у пациентов с инсультом, онкологическими заболеваниями, новой коронавирусной инфекцией, а также при многих других тяжелых заболеваниях и состояниях.

Частота постковидного синдрома у больных, лечившихся амбулаторно, составляет от 10% до 35%, в то время как у больных, перенесших заболевание в тяжелой форме, нуждавшихся в госпитализации, она может достигать 80%. Повышенная утомляемость, определяемая как

С момента выявления первых случаев новой коронавирусной инфекции COVID-19, а также объявления Всемирной организацией здравоохранения вспышки COVID-19 пандемией продолжается накопление данных о патогенном потенциале возбудителя инфекции SARS-CoV-2. В частн

С конца 2019 года мир охвачен пандемией новой коронавирусной инфекции, вызванной SARS-CoV-2. С первых дней интернациональное медицинское сообщество активно изучало острую фазу данной инфекции, однако постепенно пришло понимание того, что все более и более

COVID-19 и его последствия до сих пор остаются важной задачей для клиницистов. В этом коротком видео Вы узнаете, как можно снизить риск госпитализации и тяжелого клинического течения заболевания у амбулаторных пациентов с COVID-19

К группам высокого риска по развитию тяжелых форм новой коронавирусной инфекции относятся лица пожилого возраста, имеющие сопутствующую патологию со стороны органов дыхания, сердечно-сосудистой системы и др.

Кардиологические пациенты относятся к группе риска тяжелого течения коронавирусной инфекции, так как методы лечения COVID-19 могут иметь побочные эффекты со стороны сердечно-сосудистой системы. Также пациенты с уже существующими факторами риска сердечно-с

Постинфекционная астения не ограничивается влиянием инфекционного агента на нервную систему. Длительная гипоксия, соматическая и цереброваскулярная патология и стрессогенное воздействие – дополнительные факторы развития астенического синдрома после COVID-

Интервью с Алексеем Ртищевым, к.м.н., доцентом кафедры инфекционных болезней у детей РНИМУ им. Пирогова Минздрава России, главным специалистом по инфекционным болезням у детей в ЦАО и ЮВАО города Москвы

При отсутствии эффективного лечения COVID-19 эмпирически стали применять различные препараты. Противоречивые данные литературы, от рекомедации активного применения до полного отрицания необходимости в применении витаминов D и С при COVID-19, заставили про

С начала 2020 г. в мире распространилась инфекция, вызванная вирусом SARS-CoV-2, что в дальнейшем привело к пандемии COVID-19. Долгое время вопросы ведения пациентов с новой коронавирусной инфекцией в остром периоде рассматривались как первоочередные.

Пациенты, перенесшие COVID-19, часто сообщают о продолжающихся респираторных, неврологических и психиатрических симптомах. О роли фармакотерапии в качестве дополнения этиотропному и симптоматическому лечению постковидного синдрома – в лекции Е.Н. Каревой

Повышение качества оказания помощи больным новой коронавирусной инфекцией COVID-19 возможно только на основе мультидисциплинарного подхода. Оценка пищевого статуса и при необходимости его коррекция являются важной составляющей комплексных программ лечения

С 9 по 14 сентября 2021 года состоялся ежегодный международный Конгресс ESPEN, организованный Европейской ассоциацией клинического питания и метаболизма

Читайте также: