Новый агрессивный штамм вич

Обновлено: 26.04.2024

Анализ генетической последовательности показал, что этот высоковирулентый вариант возник в 1990-х в результате мутации de novo. В отсутствие лечения VB может развиться в СПИД за более короткий промежуток времени — примерно через два-три года.

Ученые из университетов Оксфорда, Амстердама, Парижа, Цюриха, Европейского института биоинформатики и Института Сенгера в Кембридже, Института Роберта Коха в Берлине сообщили о существовании более высоковирулентного варианта ВИЧ-1 подтипа B — VB. Так, у 109 человек с этой разновидностью выявили превышение вирусной нагрузки примерно в 3,5-5,5 раза (по сравнению с пациентами с другими штаммами подтипа B), а также ускоренное в два раза снижение числа Т-клеток. Результаты исследования опубликованы в журнале Science.

Основная группа ВИЧ, ответственная за пандемию, впервые появилась примерно в 1920-х в районе Киншасы — сегодня столицы Демократической Республики Конго, — а спустя 40 лет разделилась на подтипы, которые начали расходиться по миру своими путями. На сегодня ВИЧ-1 — самый распространенный тип вируса иммунодефицита человека, который без соответствующей терапии переходит в СПИД. Около 95 процентов людей, живущих с ВИЧ, имеют именно ВИЧ-1, в то время как ВИЧ-2 встречается в основном на западе Африки, хотя порой его фиксируют в других регионах. Оба типа относятся к ретровирусам — семейству РНК-содержащих вирусов, — но их геном идентичен лишь на 55 процентов.

Анализ образцов фекалий и крови, взятых в 1980-х годах, также подтвердил, что гомосексуальные мужчины, в ЖКТ которых выявили высокий уровень вызывающих воспаление бактерий, больше предрасположены к.

Вначале ученые, участвующие в крупном проекте BEEHIVE, определили группу из 17 человек, имеющих все признаки варианта вируса подтипа B и сильно повышенные вирусные нагрузки: 15 пациентов были из Нидерландов, один — из Швейцарии, еще один — из Бельгии. Затем, чтобы дополнить результаты и подробнее изучить эту разновидность ВИЧ-1, исследователи проанализировали данные 6706 человек из Нидерландов с инфекцией подтипа B. В итоге VB обнаружили еще у 92 человек. По словам авторов работы, он демонстрировал обширные изменения в геноме, затрагивающие почти 300 аминокислот.

Эксперименты показали, как генетическая мутация, обнаруженная у мышей и обезьян, влияет на распространение по организму ВИЧ и вируса Эбола.

Согласно их подсчетам, когда количество CD4 достигнет 200 клеток/мм 3 , существует высокая вероятность немедленных осложнений, связанных с развитием СПИД. Без лечения эта стадия наступит в среднем через два-три года у молодых пациентов с VB-вариантом ВИЧ, а не через привычные шесть-семь лет. Для больных из старших возрастных групп прогноз более неутешителен. Однако исследователи не выявили каких-либо значимых различий в показателях смертности между людьми с VB и другими ВИЧ-инфицированными: вероятно, это можно объяснить лишь тем, что они начали антиретровирусную терапию вскоре после того, как узнали свой диагноз.

История двух ВИЧ-инфицированных, которые смогли прекратить терапию на несколько лет и держать болезнь под контролем, может стать основой для разработки новых методов, чтобы в итоге добиться ремисси.

Специалисты в области здравоохранения предполагали, что разработка нескольких эффективных вакцин и последующий быстрый охват населения вакцинацией приведут к коллективному иммунитету и дальнейшему завершению пандемии. Однако задержки и перебои с поставками вакцин во многих регионах мира, а также скептическое отношение к ним у части населения привели к появлению нескольких вариантов SARS-CoV-2, характеризуемых высоким уровнем передачи и способностью ускользать от иммунного ответа. Новые штаммы SARS-Cov-2 обеспечили дальнейшее распространение вируса, которое вызвало как новые первичные инфицирования, так и повторные случаи заражения.

В ряде ранее опубликованных исследований уже указывалось на хронический характер инфекции SARS-CoV-2 среди пациентов с ослабленным иммунитетом, на неспособность их организма полностью избавиться от вируса. Длительное присутствие SARS-CoV-2 в организме обеспечивает вирусному геному возможность изменяться и адаптироваться к угрозам, включая работу антител, применяемых для лечения подобных пациентов.

Таким образом, в работе исследуется появление новых мутаций среди трех пациентов с хронической инфекцией SARS-CoV-2, возникшей в результате запущенной формы ВИЧ-инфекции.

Результаты исследования

Пациент № 1 был госпитализирован с одышкой, а также потерей веса, высокой температурой и ночной потливостью. Анализ комбинированных мазков из носа и горла (КМНГ) методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) дал положительный результат на SARS-CoV-2. У пациента также были обнаружены ВИЧ-1 и милиарный туберкулез. Ему проводилось комплексное лечение. Два месяца спустя повторный анализ дал отрицательный результат на рибонуклеиновую кислоту (РНК) SARS-CoV-2.

Пациент № 2, которому ранее диагностировали диффузную В-клеточную крупноклеточную лимфому и ВИЧ-1, был госпитализирован с инфекцией мочевыводящих путей. Пациент не соблюдал приверженность при приеме антиретровирусной терапии против ВИЧ-инфекции — диагноза, который ему поставили два десятилетия назад. Через две недели после госпитализации у пациента был выявлен положительный результат на SARS-Cov-2. В связи с одышкой пациент был подключен к кислороду.

Пациент № 3 на момент исследования жил с ВИЧ 10 лет, прерывая прием АРТ. В связи с кашлем, высокой температурой и болью в мышцах пациенту был поставлен диагноз COVID-19. Несмотря на то, что впоследствии симптомы исчезли, еженедельный анализ ПЦР продолжал давать положительный результат.

Также было обнаружено, что все пациенты имеют мутацию в E484 в рецептор-связывающем мотиве (RBM) рецептор-связывающего домена — это локация, печально известная способностью прятаться от иммунного ответа. Некоторые из этих мутаций, такие как E484K и E484G, также увеличивают аффинность RBD с ACE2.

Выводы

Настоящее исследование характеризует эволюцию SARS-CoV-2 у носителей с ослабленным иммунитетом с хронической формой инфекции, а также его адаптацию за счет новых мутаций, появившихся с течением времени. Сохранение некоторых, хотя и не всех, из них указывает на то, что SARS-CoV-2 продолжал активно размножаться внутри пациентов в результате иммунного дефицита и неспособности организма вывести из себя вирус.

Результаты данного исследования представляют собой дополнительные доказательства того, что в условиях иммуносупрессии у людей может быть хроническая инфекция SARS-CoV-2, способствующая возникновению новых вариантов вируса

Как предполагают исследователи, наличие мутации Q498R, в комбинации с мутацией N501Y, заметно способствует аффинности к рецептору ACE2. Когда наблюдаются все три мутации одновременно, как было в случае с пациентами № 1 и № 3, их совокупное воздействие должно увеличивать связку RBD-ACE2 в 50 раз по сравнению с вирусом дикого типа.

CD4 T-клетки играют центральную роль в активности нейтрализующих антител и цитотоксичных Т-клеток во время острой инфекции

Отсутствие необходимого количества CD4-клеток может привести к слабому иммунному ответу со стороны нейтрализующих антител, так как он зависит от активации Т-клеток, которые обеспечивают выздоровление и повышают скорость очистки организма от вируса. Однако, поскольку ответ от CD-4 Т-клеток либо отсутствует, либо происходит со значительной задержкой, вероятен либо смертельный исход, либо тяжелое развитие болезни. Напротив, у пациентов, участвовавших в данном исследовании, наблюдалась хроническая, но бессимптомная инфекция SARS-CoV-2, возможно, из-за участия других компонентов адаптивного иммунитета.

Большая часть населения Африки, особенно проживающая южнее Сахары, остается непривитой. Высокое число ВИЧ-положительных, треть из которых не принимает АРТ и таким образом остается с хронически ослабленным иммунитетом, говорит об опасности того, что у этих людей могут возникнуть новые мутации SARS-CoV-2. Таким образом, вопрос вакцинации должен стоять на глобальном уровне, а не на региональном.

Группа ученых под руководством профессора Кристофа Фрейзера из Института больших данных Оксфордского университета сообщили об обнаружении в Нидерландах нового более опасного и заразного штамма вируса иммунодефицита человека (ВИЧ). Соответствующая статья опубликована в журнале Science.

Исследователи обнаружили мутацию в ходе анализа образцов крови ВИЧ-инфицированных европейцев из Уганды. У 17 из них был выявлен ранее неизвестный вариант, названный VB. Из них 15 оказались жителями Нидерландов, поэтому ученые дополнительно изучили пробы, взятые у 6700 ВИЧ-положительных нидерландцев, после чего выявили еще 92 носителей.

Вирусная нагрузка у зараженных VB-вариантом ВИЧ была в несколько раз выше, чем у инфицированных уже известными вариантами вируса. Кроме того, у них был выше риск развития СПИДа и передачи инфекции. Однако после антиретровирусной терапии иммунная система приходила в норму.

Позже анализ показал, что VB-штамм появился в Нидерландах в конце 1980-х — начале 1990-х годов. В 2000-х он распространялся быстрее других вариантов ВИЧ, но после 2010 года его распространение пошло на спад. Сдержать распространение инфекции позволила эффективная борьба с ВИЧ в стране.

Ранее российские ученые нашли в тихоокеанских красных водорослях вещество, уничтожающее часть ВИЧ. Водоросли содержат нетоксичные сахара-каррагинаны, которые могут соединяться с частицами вируса иммунодефицита человека и мешать ему проникать в иммунные клетки. Сахара обладают высокой противовирусной активностью в малых концентрациях, в частности, против ВИЧ. Вещество обнаружено в водорослях вида Tichocarpus crinitus. Они часто встречаются на дне залива Петра Великого у Владивостока.

Читайте также: